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臺灣水域分離之 Paracoccus、Ideonella 、 Undibacterium 、 Neptunomonas 、 Hymenobacter 及 Mucilaginibacter 新種菌株之特性研究

為了解決澎湖bbq dcard的問題,作者謝采縈 這樣論述:

本實驗於澎湖縣馬公市馬公港海水、苗栗縣大湖鄉新開村井水 、屏東縣潮州鎮鱷魚池池水、高雄市茂林區茂林谷溪水、屏東縣泰武鄉萬安溪溪水、花蓮縣鳳林鎮林榮里溪水、嘉義縣阿里山鄉奮起湖湖水、臺中市和平區谷關水庫水、臺東縣卑南鄉卑南溪溪水等9處水源進行採樣,經過分離純化得到了135株革蘭氏陰性菌與7株為革蘭氏陽性菌。經過16S rRNA基因序列分析,菌株HPM-16、MVW-1、TAPP3、TAPP7、KYPY4、 KYPY9、CCP-1、CCP-6、CCP-7、CCP-18、BBQ-12、BBQ-18、ALO-8為具有成為新種潛力之菌株;本論文將菌株HPM-16、MVW-1、TAPP3、TAP

P7、KYPY4、KYPY9進行進一步的鑑定與特性分析。 菌株HPM-16分離於澎湖縣馬公市馬公港海水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現乳白色,規則圓形狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Neptunomonas concharum LHW37T之相似度為96.70 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株HPM-16為Neptunomonas屬中之新種細菌,將其命名為Neptunomonas marina,模式菌株為HPM-16T (= BCRC 80979T = LMG 29559T = KCTC 52236T) 。 菌

株MVW-1T分離於高雄市茂林區茂林谷溪水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現淺橘色,規則圓形狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Paracoccus caeni MJ17T之相似度為97.61 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株MVW-1T為Paracoccus屬中之新種細菌,將其命名為Paracoccus fontiphilus,模式菌株為MVW-1T (= BCRC 80974T = LMG 29554T = KCTC 52239T) 。 菌株TAPP3T分離於屏東縣泰武鄉萬安溪溪水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現鮮紅色,規

則圓形狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Hymenobacter ginsengisoli DCY57T之相似度為97.33 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株為Hymenobacter屬中之新種細菌,將其命名為Hymenobacter coccineus,模式菌株為TAPP3T (= BCRC 80979T = LMG 29559T = KCTC 52236T) 。菌株TAPP7T分離於屏東縣泰武鄉萬安溪溪水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現粉紅色,不規則狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Mu

cilaginibacter ginsengisoli B4Y-8T之相似度為97.60 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株為Mucilaginibacter屬中之新種細菌,將其命名為Mucilaginibacter amnicola,模式菌株為TAPP7T (= BCRC 80976T = LMG 29556T = KCTC 52238T) 。菌株KYPY4T分離於花蓮縣鳳林鎮林榮里溪水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現淺橘色,規則圓形狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Ideonella dechloratans CCUG 3

0898T之相似度為97.54 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株為Ideonella屬中之新種細菌,將其命名為Ideonella rivuli,模式菌株為KYPY4T (= BCRC 81010T = KCTC 52441T) 。 菌株KYPY9T分離於花蓮縣鳳林鎮林榮里溪水,為革蘭氏陰性桿菌。菌落呈現淡黃色,規則圓形狀,邊緣完整。經16S rRNA基因序列分析顯示與最相近的已知菌種Undibacterium seohonense SHS5-24T之相似度為98.01 % 。依生理生化、遺傳特徵和形態學分析等,並與鄰近模式菌株相比較,證實菌株為U

ndibacterium屬中之新種細菌,將其命名為Undibacterium amnicola,模式菌株為KYPY9T (= BCRC 81009T = LMG 29730T = KCTC 52442T) 。